/etc/apache2/sites-available/000-default.conf をコピーして/etc/apache2/sites-available/mifmif.ddo.jp.confを作る
以下を変更。
DocumentRoot /foobar/Public/pukiwiki-1.5.1_utf8/
<Directory "/foobar/Public/pukiwiki-1.5.1_utf8">
Require all granted
</Directory>
無効化
$ sudo a2dissite 000-default
有効化
$ sudo a2ensite mifmif.ddo.jp
リスタート
$ sudo service apache2 restart